1985年1月，煤炭部批准成立淮北煤炭师范学院古籍研究室，吴孟复任主任。1987年6月，殷呈祥主持研究室工作。1991年10月，学院改古籍研究室为古籍研究所，纪健生任所长。2003年学院整合科研机构，集中古籍整理研究所、历史研究所、语言研究所和中文系、历史系的研究力量与资源，成立安徽文献整理与研究中心，被安徽省教育厅批准为安徽省高等学校人文社会科学重点研究基地。副院长郜锦强兼任中心主任，纪健生、牛继清任副主任。2004年纪健生任中心主任，2007年，牛继清任中心主任。2006年，中心荣获淮北煤炭师范学院“十?五”期间科技先进集体称号，受到学院表彰奖励。
安徽文献整理与研究中心最高学术机构为学术委员会，负责指导中心研究工作，审核中心科研计划，评审中心重大项目选题、自选项目，评定中心科研奖励。安徽师范大学余恕诚教授。安徽文献整理与研究中心下设文学文献、历史文献、安徽地方文化与社会发展研究三个研究方向。文学文献方向带头人王政教授，历史文献研究方向带头人李勇教授，安徽地方文化与社会发展研究方向带头人刘亚中教授。安徽文献整理与研究中心现有专兼职研究人员18名，其中教授10名，副教授6名，讲师2名，具有博士学位者7名。主要学术带头人王政、牛继清、李勇、刘亚中、余敏辉、郭全芝。
中心编辑学术刊物两种：《古籍研究》与《安徽文献研究集刊》。《古籍研究》为反映古籍整理与研究成果与信息的专门性学术刊物，受教育部全国高校古籍整理研究工作委员会指导、资助。国内不少重点高校如复旦大学、浙江大学、南京大学、北京师大、山东大学等都列为核心期刊或重点期刊，并指定为文献研究生必读与发表论文刊物。刊物还经常发表日、韩与港台作者文章，在海外也有一定影响。
《安徽文献研究集刊》是由中心主办的专业学术丛刊，2004年创刊，每年一卷，由黄山书社出版发行。《安徽文献研究集刊》主要登载整理和研究安徽文献的相关成果，致力于弘扬安徽悠久的文献学传统。有文献学史研究、文学文献研究、历史文献研究、版本目录研究、科技文献研究、文献资料等常设栏目。主编牛继清，现已出版五卷。
安徽文献整理与研究中心专兼职研究人员取得了丰硕的科研成果。承担各级各类古籍整理与研究项目30余项，其中国家古籍整理出版重点规划4项，(国家古籍出版“十一五”重点规划“《凌廷堪全集》点校”已出版，“《唐会要》校证”书稿已交出版社，省部级以上21项。先后出版文献整理著作13种，文献研究著作20部，普及读物20多部，发表学术论文300余篇，其中在《文献》、《文史》、《史学史研究》、《文学遗产》、《孔子研究》、《周易研究》、《文学评论丛刊》、《文艺研究》、《学术月刊》、《光明日报》等重要报刊发表百篇，在境外专业学术刊物发表多篇。
中心专兼职研究人员积极参与淮北地方文化与经济建设，并接受社会咨询。应邀参与淮北柳孜“大运河遗址”的发掘、研究，承担“淮北市历史文化开发研究”“、淮北历史人物评传”等项目，为淮北历史文化资源的综合利用建言献策。参与安徽省重大文化工程项目《安徽通史?秦汉魏晋南北朝卷》编纂。